MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 1

Total Repeats: 83076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014117	TGA	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295675102
2	NC_014117	CAG	2	6	417	422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675102
3	NC_014117	ACGTG	2	10	424	433	20 %	20 %	40 %	20 %	295675102
4	NC_014117	CGG	2	6	625	630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675102
5	NC_014117	CGT	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675102
6	NC_014117	GC	3	6	654	659	0 %	0 %	50 %	50 %	295675102
7	NC_014117	CGC	2	6	673	678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675102
8	NC_014117	CGG	2	6	692	697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675102
9	NC_014117	CG	5	10	746	755	0 %	0 %	50 %	50 %	295675102
10	NC_014117	GCG	2	6	774	779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675102
11	NC_014117	CGC	2	6	782	787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675102
12	NC_014117	GCC	2	6	810	815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675102
13	NC_014117	CGC	2	6	821	826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675102
14	NC_014117	GGC	2	6	883	888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675102
15	NC_014117	GGGCGC	2	12	896	907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675102
16	NC_014117	GGC	2	6	908	913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675102
17	NC_014117	GC	3	6	1141	1146	0 %	0 %	50 %	50 %	295675102
18	NC_014117	CGA	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675102
19	NC_014117	CTA	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675102
20	NC_014117	CTCG	2	8	1238	1245	0 %	25 %	25 %	50 %	295675102
21	NC_014117	CTG	3	9	1248	1256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675102
22	NC_014117	CGA	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675102
23	NC_014117	CGCA	2	8	1290	1297	25 %	0 %	25 %	50 %	295675102
24	NC_014117	TTC	2	6	1305	1310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295675102
25	NC_014117	ATC	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675102
26	NC_014117	CGA	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675102
27	NC_014117	GCC	2	6	1442	1447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675102
28	NC_014117	TTC	2	6	1524	1529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295675102
29	NC_014117	GC	3	6	1570	1575	0 %	0 %	50 %	50 %	295675102
30	NC_014117	CTG	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675102
31	NC_014117	AGA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675102
32	NC_014117	GAA	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675102
33	NC_014117	CG	3	6	1766	1771	0 %	0 %	50 %	50 %	295675102
34	NC_014117	AGA	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675102
35	NC_014117	CGG	2	6	1844	1849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675102
36	NC_014117	ACG	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675102
37	NC_014117	CGA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675102
38	NC_014117	GCA	2	6	1900	1905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675102
39	NC_014117	CCT	2	6	2476	2481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295675103
40	NC_014117	TCG	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675103
41	NC_014117	CGC	2	6	2516	2521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675103
42	NC_014117	CGAC	2	8	2586	2593	25 %	0 %	25 %	50 %	295675103
43	NC_014117	CAC	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295675103
44	NC_014117	GC	3	6	2614	2619	0 %	0 %	50 %	50 %	295675103
45	NC_014117	TCGGCG	2	12	2625	2636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295675103
46	NC_014117	GGC	2	6	2659	2664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675103
47	NC_014117	GC	3	6	2663	2668	0 %	0 %	50 %	50 %	295675103
48	NC_014117	CTC	2	6	2672	2677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295675103
49	NC_014117	GC	3	6	2686	2691	0 %	0 %	50 %	50 %	295675103
50	NC_014117	ACGCTG	2	12	2711	2722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295675103
51	NC_014117	CGG	2	6	2781	2786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675103
52	NC_014117	GCT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675103
53	NC_014117	CAG	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675103
54	NC_014117	CTA	2	6	2905	2910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675103
55	NC_014117	TGG	3	9	2928	2936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295675103
56	NC_014117	ACGG	2	8	2963	2970	25 %	0 %	50 %	25 %	295675103
57	NC_014117	TCG	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675103
58	NC_014117	CG	3	6	3013	3018	0 %	0 %	50 %	50 %	295675103
59	NC_014117	CGA	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675103
60	NC_014117	ACATCG	2	12	3093	3104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	295675103
61	NC_014117	GAA	2	6	3230	3235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675103
62	NC_014117	CGCT	2	8	3242	3249	0 %	25 %	25 %	50 %	295675103
63	NC_014117	CG	3	6	3254	3259	0 %	0 %	50 %	50 %	295675103
64	NC_014117	TCG	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675103
65	NC_014117	GAA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675103
66	NC_014117	ACG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675103
67	NC_014117	ACG	2	6	3510	3515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675103
68	NC_014117	GTG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295675103
69	NC_014117	TGAC	2	8	3666	3673	25 %	25 %	25 %	25 %	295675104
70	NC_014117	TCCA	2	8	3713	3720	25 %	25 %	0 %	50 %	295675104
71	NC_014117	TCGA	2	8	3827	3834	25 %	25 %	25 %	25 %	295675104
72	NC_014117	ATC	2	6	3872	3877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675104
73	NC_014117	GAC	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675104
74	NC_014117	AGCGC	2	10	3960	3969	20 %	0 %	40 %	40 %	295675104
75	NC_014117	TGA	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295675104
76	NC_014117	CGG	2	6	4000	4005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
77	NC_014117	GGC	2	6	4037	4042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
78	NC_014117	GGCGTG	2	12	4049	4060	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	295675104
79	NC_014117	CGTG	2	8	4062	4069	0 %	25 %	50 %	25 %	295675104
80	NC_014117	AAG	2	6	4115	4120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675104
81	NC_014117	TCG	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675104
82	NC_014117	GCG	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
83	NC_014117	CAA	2	6	4420	4425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295675104
84	NC_014117	CAT	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675104
85	NC_014117	GTGCT	2	10	4529	4538	0 %	40 %	40 %	20 %	295675104
86	NC_014117	AAC	2	6	4544	4549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295675104
87	NC_014117	CGG	2	6	4564	4569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
88	NC_014117	TGCG	2	8	4587	4594	0 %	25 %	50 %	25 %	295675104
89	NC_014117	CG	3	6	4602	4607	0 %	0 %	50 %	50 %	295675104
90	NC_014117	GAA	2	6	4642	4647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675104
91	NC_014117	CGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675104
92	NC_014117	CGTG	2	8	4692	4699	0 %	25 %	50 %	25 %	295675104
93	NC_014117	GTC	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675104
94	NC_014117	GC	4	8	4768	4775	0 %	0 %	50 %	50 %	295675104
95	NC_014117	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675104
96	NC_014117	ATC	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675104
97	NC_014117	TCG	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675104
98	NC_014117	GCG	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
99	NC_014117	GC	3	6	4874	4879	0 %	0 %	50 %	50 %	295675104
100	NC_014117	GC	3	6	4886	4891	0 %	0 %	50 %	50 %	295675104
101	NC_014117	CGT	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675104
102	NC_014117	TCG	2	6	4998	5003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675104
103	NC_014117	CGG	2	6	5013	5018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
104	NC_014117	GCT	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675104
105	NC_014117	ATC	2	6	5213	5218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675104
106	NC_014117	TTC	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295675104
107	NC_014117	GAT	2	6	5293	5298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295675104
108	NC_014117	GCC	2	6	5326	5331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675104
109	NC_014117	TTC	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295675104
110	NC_014117	TGG	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295675104
111	NC_014117	GGT	2	6	5509	5514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295675104
112	NC_014117	GATG	2	8	5560	5567	25 %	25 %	50 %	0 %	295675104
113	NC_014117	TC	3	6	5581	5586	0 %	50 %	0 %	50 %	295675104
114	NC_014117	GGC	2	6	5596	5601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
115	NC_014117	CG	3	6	5615	5620	0 %	0 %	50 %	50 %	295675104
116	NC_014117	GAT	2	6	5639	5644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295675104
117	NC_014117	CG	3	6	5713	5718	0 %	0 %	50 %	50 %	295675104
118	NC_014117	CAT	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675104
119	NC_014117	AGA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675104
120	NC_014117	CGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675104
121	NC_014117	CAG	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675104
122	NC_014117	GCTG	2	8	5899	5906	0 %	25 %	50 %	25 %	295675104
123	NC_014117	AGC	2	6	5928	5933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675104
124	NC_014117	AGC	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675104
125	NC_014117	GAC	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675104
126	NC_014117	GCG	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675104
127	NC_014117	TCT	2	6	6004	6009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295675104
128	NC_014117	TGC	2	6	6034	6039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675104
129	NC_014117	TAC	2	6	6052	6057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675104
130	NC_014117	TGA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295675104
131	NC_014117	GCA	2	6	7302	7307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
132	NC_014117	GCGA	2	8	7308	7315	25 %	0 %	50 %	25 %	295675105
133	NC_014117	AGA	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675105
134	NC_014117	CGC	2	6	7328	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675105
135	NC_014117	TACG	2	8	7360	7367	25 %	25 %	25 %	25 %	295675105
136	NC_014117	CGA	2	6	7400	7405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
137	NC_014117	ATC	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675105
138	NC_014117	GAC	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
139	NC_014117	GCT	2	6	7490	7495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675105
140	NC_014117	ACCGAC	2	12	7506	7517	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	295675105
141	NC_014117	CAG	2	6	7546	7551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
142	NC_014117	CGC	2	6	7559	7564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675105
143	NC_014117	CGC	2	6	7598	7603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675105
144	NC_014117	TCA	2	6	7621	7626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295675105
145	NC_014117	CGGT	2	8	7642	7649	0 %	25 %	50 %	25 %	295675105
146	NC_014117	ACC	2	6	7684	7689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295675105
147	NC_014117	CGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
148	NC_014117	CGC	2	6	7712	7717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675105
149	NC_014117	GCG	2	6	7747	7752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675105
150	NC_014117	CGC	2	6	7790	7795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675105
151	NC_014117	CTG	3	9	7806	7814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675105
152	NC_014117	CGA	2	6	7820	7825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
153	NC_014117	CACG	2	8	7868	7875	25 %	0 %	25 %	50 %	295675105
154	NC_014117	CGC	2	6	7889	7894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675105
155	NC_014117	TCGC	2	8	7974	7981	0 %	25 %	25 %	50 %	295675105
156	NC_014117	ACG	2	6	7999	8004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
157	NC_014117	GCA	2	6	8035	8040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
158	NC_014117	GGGCA	2	10	8061	8070	20 %	0 %	60 %	20 %	295675105
159	NC_014117	CAG	2	6	8106	8111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675105
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161	NC_014117	CG	3	6	8138	8143	0 %	0 %	50 %	50 %	295675105
162	NC_014117	GGT	2	6	8171	8176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295675105
163	NC_014117	CG	3	6	8223	8228	0 %	0 %	50 %	50 %	295675105
164	NC_014117	GCT	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675105
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167	NC_014117	GCT	2	6	8339	8344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675105
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201	NC_014117	CG	3	6	9829	9834	0 %	0 %	50 %	50 %	295675107
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248	NC_014117	TCGG	2	8	11482	11489	0 %	25 %	50 %	25 %	295675107
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255	NC_014117	CCG	2	6	11677	11682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675107
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258	NC_014117	TCG	2	6	11806	11811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675107
259	NC_014117	CGGT	2	8	11836	11843	0 %	25 %	50 %	25 %	295675107
260	NC_014117	ACG	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675108
261	NC_014117	CTG	2	6	12006	12011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675108
262	NC_014117	CG	3	6	12093	12098	0 %	0 %	50 %	50 %	295675108
263	NC_014117	ACG	2	6	12112	12117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675108
264	NC_014117	TGC	2	6	12130	12135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675108
265	NC_014117	GCG	2	6	12163	12168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675108
266	NC_014117	GCAT	2	8	12169	12176	25 %	25 %	25 %	25 %	295675108
267	NC_014117	GAA	2	6	12219	12224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675108
268	NC_014117	GCA	2	6	12227	12232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675108
269	NC_014117	CGT	2	6	12541	12546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675109
270	NC_014117	GCG	2	6	12591	12596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675109
271	NC_014117	CG	3	6	12595	12600	0 %	0 %	50 %	50 %	295675109
272	NC_014117	AGC	2	6	12648	12653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675109
273	NC_014117	GCC	2	6	12660	12665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675109
274	NC_014117	CCCA	2	8	12724	12731	25 %	0 %	0 %	75 %	295675110
275	NC_014117	CCGC	2	8	12763	12770	0 %	0 %	25 %	75 %	295675110
276	NC_014117	GCC	2	6	12823	12828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675110
277	NC_014117	CGG	2	6	12846	12851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675110
278	NC_014117	TGATC	2	10	12855	12864	20 %	40 %	20 %	20 %	295675110
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281	NC_014117	CG	3	6	12930	12935	0 %	0 %	50 %	50 %	295675110
282	NC_014117	CG	3	6	12971	12976	0 %	0 %	50 %	50 %	295675110
283	NC_014117	CCG	2	6	13005	13010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675110
284	NC_014117	CG	5	10	13014	13023	0 %	0 %	50 %	50 %	295675110
285	NC_014117	GAA	2	6	13024	13029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295675110
286	NC_014117	GCG	2	6	13052	13057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675110
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288	NC_014117	CGT	2	6	13104	13109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675110
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291	NC_014117	CGA	2	6	13188	13193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675110
292	NC_014117	CTT	2	6	13218	13223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295675110
293	NC_014117	CGA	2	6	13224	13229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675110
294	NC_014117	CG	3	6	13242	13247	0 %	0 %	50 %	50 %	295675110
295	NC_014117	GCT	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675110
296	NC_014117	GAAG	2	8	13338	13345	50 %	0 %	50 %	0 %	295675110
297	NC_014117	ACG	2	6	13364	13369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675110
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322	NC_014117	CGCGAG	2	12	14751	14762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	295675111
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372	NC_014117	GAT	2	6	16874	16879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295675113
373	NC_014117	TGC	2	6	16926	16931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295675113
374	NC_014117	GCA	2	6	16960	16965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675113
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380	NC_014117	CGG	2	6	17154	17159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675113
381	NC_014117	GC	3	6	17170	17175	0 %	0 %	50 %	50 %	295675113
382	NC_014117	CG	4	8	17191	17198	0 %	0 %	50 %	50 %	295675113
383	NC_014117	GC	3	6	17229	17234	0 %	0 %	50 %	50 %	295675113
384	NC_014117	CGA	2	6	17242	17247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295675113
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386	NC_014117	CG	3	6	17288	17293	0 %	0 %	50 %	50 %	295675113
387	NC_014117	CGC	2	6	17316	17321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295675113
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389	NC_014117	GCG	2	6	17368	17373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295675113
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